CHD4













































































Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4

Protein CHD4 PDB 1mm2.png
PDB представлено на примере 1mm2.











Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB









Идентификаторы
Символ
CHD4 ; CHD-4; Mi-2b; Mi2-BETA
Внешние ID
OMIM: 603277 MGI: 1344380 HomoloGene: 68175 GeneCards: CHD4 Gene
номер EC 3.6.4.12

















Профиль экспрессии РНК
PBB GE CHD4 201183 s at tn.png
PBB GE CHD4 201182 s at tn.png
PBB GE CHD4 201184 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 1108 107932
Ensembl ENSG00000111642 ENSMUSG00000063870
UniProt Q14839 Q6PDQ2
RefSeq (мРНК) NM_001273 NM_145979
RefSeq (белок) NP_001264 NP_666091
Локус (UCSC) Chr 12:
6.68 – 6.72 Mb		 Chr 6:
125.1 – 125.13 Mb
Поиск в PubMed
 [1] [2]

Шаблон: просмотр • обсуждение • править

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4 — фермент, кодируемый у человека геном CHD4.[1][2][3]


Продукт этого гена относится к семейству геликаз SNF2/RAD54. Оно представляет собой основной компонент нуклеосомного ремоделирования и комплекса деацетилаз и играет важную роль в эпигенетической репрессии транскрипции. У пациентов с дерматомиозитом вырабатываются антитела против этого белка.[3]



Взаимодействия |


CHD4, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1,[4][5][6]гистондезацетилазой 2,[7][8][6]MTA2,[4]SATB1[9] и ATR.[8]



Примечания |





  1. ↑ Seelig HP, Moosbrugger I, Ehrfeld H, Fink T, Renz M, Genth E (Nov 1995). “The major dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen is a presumed helicase involved in transcriptional activation”. Arthritis Rheum. 38 (10): 1389—99. DOI:10.1002/art.1780381006. PMID 7575689..mw-parser-output cite.citation{font-style:inherit}.mw-parser-output q{quotes:"""""""'""'"}.mw-parser-output code.cs1-code{color:inherit;background:inherit;border:inherit;padding:inherit}.mw-parser-output .cs1-lock-free a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/65/Lock-green.svg/9px-Lock-green.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-lock-limited a,.mw-parser-output .cs1-lock-registration a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d6/Lock-gray-alt-2.svg/9px-Lock-gray-alt-2.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-lock-subscription a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/aa/Lock-red-alt-2.svg/9px-Lock-red-alt-2.svg.png")no-repeat;background-position:right .1em center}.mw-parser-output .cs1-subscription,.mw-parser-output .cs1-registration{color:#555}.mw-parser-output .cs1-subscription span,.mw-parser-output .cs1-registration span{border-bottom:1px dotted;cursor:help}.mw-parser-output .cs1-hidden-error{display:none;font-size:100%}.mw-parser-output .cs1-visible-error{font-size:100%}.mw-parser-output .cs1-subscription,.mw-parser-output .cs1-registration,.mw-parser-output .cs1-format{font-size:95%}.mw-parser-output .cs1-kern-left,.mw-parser-output .cs1-kern-wl-left{padding-left:0.2em}.mw-parser-output .cs1-kern-right,.mw-parser-output .cs1-kern-wl-right{padding-right:0.2em}


  2. ↑ Seelig HP, Renz M, Targoff IN, Ge Q, Frank MB (Nov 1996). “Two forms of the major antigenic protein of the dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen”. Arthritis Rheum. 39 (10): 1769—71. DOI:10.1002/art.1780391029. PMID 8843877.


  3. ↑ 12 Entrez Gene: CHD4 chromodomain helicase DNA binding protein 4.


  4. ↑ 12 Yao, Ya-Li; Yang Wen-Ming (Oct 2003). “The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity”. J. Biol. Chem. United States. 278 (43): 42560—8. DOI:10.1074/jbc.M302955200. ISSN 0021-9258. PMID 12920132.


  5. ↑ Grozinger, C M; Hassig C A; Schreiber S L (Apr 1999). “Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. UNITED STATES. 96 (9): 4868—73. DOI:10.1073/pnas.96.9.4868. ISSN 0027-8424. PMC 21783. PMID 10220385.


  6. ↑ 12 Tong, J K; Hassig C A; Schnitzler G R; Kingston R E; Schreiber S L (Oct 1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. ENGLAND. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. ISSN 0028-0836. PMID 9804427.


  7. ↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin (Feb 2003). “A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes”. J. Biol. Chem. United States. 278 (9): 7234—9. DOI:10.1074/jbc.M208992200. ISSN 0021-9258. PMID 12493763.


  8. ↑ 12 Schmidt, D R; Schreiber S L (Nov 1999). “Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4”. Biochemistry. UNITED STATES. 38 (44): 14711—7. DOI:10.1021/bi991614n. ISSN 0006-2960. PMID 10545197.


  9. ↑ Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi (Oct 2002). “SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances”. Nature. England. 419 (6907): 641—5. DOI:10.1038/nature01084. ISSN 0028-0836. PMID 12374985. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)




Литература |





  • Denslow SA, Wade PA (2007). “The human Mi-2/NuRD complex and gene regulation”. Oncogene. 26 (37): 5433—8. DOI:10.1038/sj.onc.1210611. PMID 17694084.


  • Ge Q, Nilasena DS, O'Brien CA; et al. (1995). “Molecular analysis of a major antigenic region of the 240-kD protein of Mi-2 autoantigen”. J. Clin. Invest. 96 (4): 1730—7. DOI:10.1172/JCI118218. PMC 185809. PMID 7560064.


  • Woodage T, Basrai MA, Baxevanis AD; et al. (1997). “Characterization of the CHD family of proteins”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (21): 11472—7. DOI:10.1073/pnas.94.21.11472. PMC 23509. PMID 9326634.


  • Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP; et al. (1998). “The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities”. Cell. 95 (2): 279—89. DOI:10.1016/S0092-8674(00)81758-4. PMID 9790534.


  • Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR; et al. (1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. PMID 9804427.


  • Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H; et al. (1999). “Analysis of the NuRD subunits reveals a histone deacetylase core complex and a connection with DNA methylation”. Genes Dev. 13 (15): 1924—35. DOI:10.1101/gad.13.15.1924. PMC 316920. PMID 10444591.


  • Schmidt DR, Schreiber SL (1999). “Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4”. Biochemistry. 38 (44): 14711—7. DOI:10.1021/bi991614n. PMID 10545197.


  • Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR; et al. (2001). “Stable histone deacetylase complexes distinguished by the presence of SANT domain proteins CoREST/kiaa0071 and Mta-L1”. J. Biol. Chem. 276 (9): 6817—24. DOI:10.1074/jbc.M007372200. PMID 11102443.


  • Andersen JS, Lyon CE, Fox AH; et al. (2002). “Directed proteomic analysis of the human nucleolus”. Curr. Biol. 12 (1): 1—11. DOI:10.1016/S0960-9822(01)00650-9. PMID 11790298.


  • Koipally J, Georgopoulos K (2002). “A molecular dissection of the repression circuitry of Ikaros”. J. Biol. Chem. 277 (31): 27697—705. DOI:10.1074/jbc.M201694200. PMID 12015313.


  • Saito M, Ishikawa F (2002). “The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2”. J. Biol. Chem. 277 (38): 35434—9. DOI:10.1074/jbc.M203455200. PMID 12124384.


  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH; et al. (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.


  • Hakimi MA, Dong Y, Lane WS; et al. (2003). “A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes”. J. Biol. Chem. 278 (9): 7234—9. DOI:10.1074/jbc.M208992200. PMID 12493763.


  • Kwan AH, Gell DA, Verger A; et al. (2004). “Engineering a protein scaffold from a PHD finger”. Structure. 11 (7): 803—13. DOI:10.1016/S0969-2126(03)00122-9. PMID 12842043.


  • Shimono Y, Murakami H, Kawai K; et al. (2004). “Mi-2 beta associates with BRG1 and RET finger protein at the distinct regions with transcriptional activating and repressing abilities”. J. Biol. Chem. 278 (51): 51638—45. DOI:10.1074/jbc.M309198200. PMID 14530259.


  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T; et al. (2004). “Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs”. Nat. Genet. 36 (1): 40—5. DOI:10.1038/ng1285. PMID 14702039.


  • Williams CJ, Naito T, Arco PG; et al. (2004). “The chromatin remodeler Mi-2beta is required for CD4 expression and T cell development”. Immunity. 20 (6): 719—33. DOI:10.1016/j.immuni.2004.05.005. PMID 15189737.


  • Lehner B, Sanderson CM (2004). “A protein interaction framework for human mRNA degradation”. Genome Res. 14 (7): 1315—23. DOI:10.1101/gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747.









-

Popular posts from this blog

Steve Gadd

Image
For other people named Steve Gadd, see Steve Gadd (disambiguation). Steve Gadd Gadd at Bodø Jazz Open, 2014 Background information Birth name Stephen Kendall Gadd Born ( 1945-04-09 ) April 9, 1945 (age 73) Irondequoit, New York, U.S. Genres Jazz post-bop jazz fusion rock blues R&B Occupation(s) Musician, drummer, percussionist and session musician Instruments Drums, percussion Years active 1968–present Website www.drstevegadd.com Stephen Kendall Gadd (born April 9, 1945 [1] ) is an American drummer, percussionist, and session musician. Gadd is one of the most well-known and highly regarded session and studio drummers in the industry, recognized by his induction into the Modern Drummer Hall of Fame in 1984. [2] Gadd's performance on Paul Simon's "50 Ways to Leave Your Lover" and Steely Dan's "Aja" are examples of his style. He has worked with popular musicians from many genres including Simon &
Read more

Лира (музыкальный инструмент)

Image
У этого термина существуют и другие значения, см. Лира. Лира Аполлон с лирой, ок. 460 до н. э. Археологический музей в Дельфах. Классификация Струнный инструмент, Хордофон Родственные инструменты Арфа  Лира на Викискладе Ли́ра (др.-греч. λύρα , лат.  lyra ) — старинный струнный щипковый инструмент (хордофон). Содержание 1 Лира в античности 1.1 Общая характеристика 1.2 Этос и функционирование лиры 2 Другие значения термина 3 Рецепция 4 Примечания 5 Литература Лира в античности | Общая характеристика | В Древней Греции и Древнем Риме словом лира в широком смысле обозначался любой инструмент семейства лир — хе́лис (др.-греч. χέλυς , лат.  chelys, chelis букв. черепаха), ба́рбит (др.-греч. βάρβιτον, βάρβιτος , лат.  barbitos, barbitus ), фо́рминга (др.-греч. φόρμιγξ ), или кифара (др.-греч. κιθάρα , лат.  cithara ). В узком смысле лирой назывался хелис — простейшая и самая лёгкая по весу из лир, с корпусом из панци
Read more

Сарыагашский район

Image
район Сарыагашский район Сарыағаш ауданы Герб Страна Казахстан Входит в Туркестанскую область Включает 14 административных единиц [1] Административный центр Сарыагаш Дата образования 16 октября 1939 Аким Абдуалиев Кайрат Аманкелдинович Заместитель акима Таскулов Смайл Абубакирович Заместитель акима Есбаев Акментай Усенович ВВП ВВП на душу населения 141,436 млн. тенге ( 2014 ) 66,837 тенге Официальные языки казахский, русский языки Население 183 363 [2]  чел. ( 2018 )( 2-е место ) Плотность 41 чел./км² Национальный состав казахи - 88,57% узбеки - 3,65% таджики - 2,76% русские - 0,88% другие национальности - 4,14%(2016г.) [3] Конфессиональный состав мусульмане Площадь 4170,74 [1]  км² Часовой пояс UTC+6 Код автом. номеров Х, 13 Официальный сайт Сарыагашский район  — район Туркестанской области Республики Казахстан. Административный центр — город Сарыагаш.
Read more